Dalam pasangan basa DNA purin (A dan G) berpasangan khusus dengan pirimidin (T dan C), dimana A selalu berpasangan dengan T yang memiliki dua situs yang membentuk ikatan hidrogen dan G selalu berpasangan dengan T yang memiliki tiga situs dan membentuk ikatan hidrogen. Jadi kesimpulannya mengapa A selalu berpasangan dengan T dan G selalu berpasangan dengan C karena ukuran dan bentuknya sangat cocok untuk ikatan hidrogen. Ikatan hidrogen antar basa komplementer ini lah yang mengikat kedua untai DNA